Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3G9

TMEM130, Transmembrane protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM130Q8N3G9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM130Q8N3G9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM130Q8N3G9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM130Q8N3G9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms