Protein–RNA interactions for Protein: Q8N187

CARF, Calcium-responsive transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARFQ8N187 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CARFQ8N187 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CARFQ8N187 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CARFQ8N187 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms