Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFTPA2Q8IWL1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFTPA2Q8IWL1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFTPA2Q8IWL1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFTPA2Q8IWL1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms