Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KSR1Q8IVT5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KSR1Q8IVT5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KSR1Q8IVT5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KSR1Q8IVT5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms