Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV13

CCNJL, Cyclin-J-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJLQ8IV13 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNJLQ8IV13 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNJLQ8IV13 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNJLQ8IV13 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNJLQ8IV13 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms