Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7F7

MRPL55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL55Q7Z7F7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL55Q7Z7F7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MRPL55Q7Z7F7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL55Q7Z7F7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL55Q7Z7F7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MRPL55Q7Z7F7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms