Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J8

UBE3D, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3DQ7Z6J8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE3DQ7Z6J8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3DQ7Z6J8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3DQ7Z6J8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3DQ7Z6J8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3DQ7Z6J8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3DQ7Z6J8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3DQ7Z6J8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3DQ7Z6J8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms