Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTW8

OTOA, Otoancorin, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOAQ7RTW8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOAQ7RTW8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OTOAQ7RTW8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OTOAQ7RTW8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms