Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT2Q7L5N7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT2Q7L5N7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPCAT2Q7L5N7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT2Q7L5N7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms