Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.429e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.419e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.399e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.369e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.319e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.169e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.169e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.159e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AGRN-206ENST00000477585 707 ntTSL 322.22■■□□□ 1.159e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.049e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FBXW11-212ENST00000523843 2099 ntTSL 521.5■■□□□ 1.039e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.989e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.979e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OSBPL8-217ENST00000553139 902 ntTSL 320.95■□□□□ 0.949e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.89e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-203ENST00000461377 1983 ntTSL 520.06■□□□□ 0.89e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PTP4A2-215ENST00000533408 376 ntTSL 319.97■□□□□ 0.799e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TOP1MT-206ENST00000518951 1461 ntTSL 519.77■□□□□ 0.769e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.719e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OTUD5-205ENST00000455452 2077 ntTSL 519.5■□□□□ 0.719e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AC087633.2-203ENST00000618377 489 ntTSL 519.28■□□□□ 0.689e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.652e-13■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.659e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.649e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-207ENST00000562155 1757 ntTSL 518.99■□□□□ 0.639e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OSBPL8-212ENST00000550628 561 ntTSL 418.99■□□□□ 0.639e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.619e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KIF1A-211ENST00000492812 2192 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.589e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-216ENST00000488727 1719 ntTSL 518.62■□□□□ 0.579e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.559e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.549e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.519e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.489e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OSBPL8-205ENST00000547540 2583 ntTSL 1 (best)18.02■□□□□ 0.489e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-14■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.449e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.448e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.448e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-14■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 317.67■□□□□ 0.429e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.412e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TOP1MT-207ENST00000519139 1561 ntTSL 517.61■□□□□ 0.419e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.412e-14■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TNNT1-217ENST00000593194 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.52■□□□□ 0.42e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 MAD1L1-205ENST00000421113 564 ntTSL 417.5■□□□□ 0.399e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PTP4A2-212ENST00000529477 568 ntTSL 317.48■□□□□ 0.399e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-217ENST00000566661 2232 ntTSL 517.42■□□□□ 0.389e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 IDH1-206ENST00000451391 563 ntTSL 317.41■□□□□ 0.389e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CPNE7-208ENST00000566398 672 ntTSL 317.35■□□□□ 0.379e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.369e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.369e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ASIC4-205ENST00000474489 2403 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.352e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.359e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.349e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OSBPL8-211ENST00000549646 588 ntTSL 517.16■□□□□ 0.349e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OSBPL8-210ENST00000549570 732 ntTSL 317.16■□□□□ 0.349e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PTP4A2-214ENST00000532289 610 ntTSL 317.11■□□□□ 0.339e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CPNE7-209ENST00000568977 682 ntTSL 516.92■□□□□ 0.39e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KIF1A-202ENST00000404283 4654 ntTSL 516.85■□□□□ 0.299e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.279e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.269e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.257e-19■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-202ENST00000316853 1287 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.259e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CPNE7-204ENST00000526232 488 ntTSL 316.51■□□□□ 0.239e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.239e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-215ENST00000566349 1377 ntTSL 216.4■□□□□ 0.229e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZC3H3-202ENST00000528401 546 ntTSL 316.31■□□□□ 0.29e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.29e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.199e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.198e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CPNE7-207ENST00000564421 517 ntTSL 316.24■□□□□ 0.199e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 MAP3K11-206ENST00000527304 5605 nt16.2■□□□□ 0.189e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.183e-8■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.175e-11■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.168e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF436-AS1-204ENST00000458053 375 ntTSL 216.01■□□□□ 0.159e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.159e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-205ENST00000472223 981 ntTSL 315.96■□□□□ 0.159e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.149e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.149e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TBRG4-216ENST00000495078 548 ntTSL 415.77■□□□□ 0.129e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TBRG4-205ENST00000471142 544 ntTSL 415.77■□□□□ 0.129e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FANCI-209ENST00000565255 754 ntTSL 315.73■□□□□ 0.119e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.115e-11■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.19e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FANCI-208ENST00000564920 562 ntTSL 515.66■□□□□ 0.19e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.099e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.099e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.075e-11■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KIF1A-205ENST00000431776 1072 ntTSL 515.43■□□□□ 0.069e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 UBE2O-202ENST00000586409 3579 ntTSL 215.42■□□□□ 0.069e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.062e-10■■■■■ 29.6
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 161 ms