RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272542.7

SLC20A1-201, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC20A1, Length 3,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-201ENST00000272542 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.51■■■□□ 2.95
SLC20A1-201ENST00000272542 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.85■■■□□ 2.21
SLC20A1-201ENST00000272542 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.6■■■□□ 2.17
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.35■■■□□ 2.13
SLC20A1-201ENST00000272542 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
SLC20A1-201ENST00000272542 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCC9O60706 1549 aa27.22■■□□□ 1.95
SLC20A1-201ENST00000272542 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.21■■□□□ 1.95
SLC20A1-201ENST00000272542 SCRIBQ14160 1630 aa26.96■■□□□ 1.91
SLC20A1-201ENST00000272542 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.9■■□□□ 1.9
SLC20A1-201ENST00000272542 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC20A1-201ENST00000272542 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SLC20A1-201ENST00000272542 NACADO15069 1562 aa26.45■■□□□ 1.83
SLC20A1-201ENST00000272542 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.4■■□□□ 1.82
SLC20A1-201ENST00000272542 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC20A1-201ENST00000272542 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
SLC20A1-201ENST00000272542 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC20A1-201ENST00000272542 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC20A1-201ENST00000272542 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SLC20A1-201ENST00000272542 TRIM41Q8WV44 630 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC20A1-201ENST00000272542 WIZO95785 1651 aa25.98■■□□□ 1.75
SLC20A1-201ENST00000272542 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.84■■□□□ 1.73
SLC20A1-201ENST00000272542 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.76■■□□□ 1.71
SLC20A1-201ENST00000272542 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SLC20A1-201ENST00000272542 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.55■■□□□ 1.68
SLC20A1-201ENST00000272542 SMARCA4P51532 1647 aa25.55■■□□□ 1.68
SLC20A1-201ENST00000272542 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.47■■□□□ 1.67
SLC20A1-201ENST00000272542 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCC8Q09428 1581 aa25.37■■□□□ 1.65
SLC20A1-201ENST00000272542 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SLC20A1-201ENST00000272542 SMARCA2P51531 1590 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC20A1-201ENST00000272542 HRCP23327 699 aa25.3■■□□□ 1.64
SLC20A1-201ENST00000272542 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SLC20A1-201ENST00000272542 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SLC20A1-201ENST00000272542 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.11■■□□□ 1.61
SLC20A1-201ENST00000272542 SOGA1O94964 1423 aa25.1■■□□□ 1.61
SLC20A1-201ENST00000272542 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SLC20A1-201ENST00000272542 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.03■■□□□ 1.6
SLC20A1-201ENST00000272542 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SLC20A1-201ENST00000272542 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SLC20A1-201ENST00000272542 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.92■■□□□ 1.58
SLC20A1-201ENST00000272542 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.9■■□□□ 1.58
SLC20A1-201ENST00000272542 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
SLC20A1-201ENST00000272542 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SLC20A1-201ENST00000272542 SYNJ1O43426 1573 aa24.74■■□□□ 1.55
SLC20A1-201ENST00000272542 CEP162Q5TB80 1403 aa24.67■■□□□ 1.54
SLC20A1-201ENST00000272542 NCAPD3P42695 1498 aa24.6■■□□□ 1.53
SLC20A1-201ENST00000272542 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC20A1-201ENST00000272542 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SLC20A1-201ENST00000272542 EEA1Q15075 1411 aa24.51■■□□□ 1.51
SLC20A1-201ENST00000272542 GOLGA3Q08378 1498 aa24.48■■□□□ 1.51
SLC20A1-201ENST00000272542 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.44■■□□□ 1.5
SLC20A1-201ENST00000272542 HMGXB3Q12766 1538 aa24.42■■□□□ 1.5
SLC20A1-201ENST00000272542 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.36■■□□□ 1.49
SLC20A1-201ENST00000272542 CUX1P39880 1505 aa24.33■■□□□ 1.49
SLC20A1-201ENST00000272542 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SLC20A1-201ENST00000272542 TOP2BQ02880 1626 aa24.33■■□□□ 1.49
SLC20A1-201ENST00000272542 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.33■■□□□ 1.49
SLC20A1-201ENST00000272542 CFTRP13569 1480 aa24.33■■□□□ 1.49
SLC20A1-201ENST00000272542 CLIP1P30622 1438 aa24.31■■□□□ 1.48
SLC20A1-201ENST00000272542 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.29■■□□□ 1.48
SLC20A1-201ENST00000272542 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SLC20A1-201ENST00000272542 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.23■■□□□ 1.47
SLC20A1-201ENST00000272542 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SLC20A1-201ENST00000272542 KIF21BO75037 1637 aa24.19■■□□□ 1.46
SLC20A1-201ENST00000272542 APLP2Q06481 763 aa24.16■■□□□ 1.46
SLC20A1-201ENST00000272542 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.15■■□□□ 1.46
SLC20A1-201ENST00000272542 NESP48681 1621 aa24.13■■□□□ 1.45
SLC20A1-201ENST00000272542 KIF27Q86VH2 1401 aa24.12■■□□□ 1.45
SLC20A1-201ENST00000272542 PRXQ9BXM0 1461 aa24.08■■□□□ 1.44
SLC20A1-201ENST00000272542 CUX2O14529 1486 aa24.07■■□□□ 1.44
SLC20A1-201ENST00000272542 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.06■■□□□ 1.44
SLC20A1-201ENST00000272542 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SLC20A1-201ENST00000272542 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24■■□□□ 1.43
SLC20A1-201ENST00000272542 IGF1RP08069 1367 aa24■■□□□ 1.43
SLC20A1-201ENST00000272542 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24■■□□□ 1.43
SLC20A1-201ENST00000272542 P3H3Q8IVL6 736 aa23.99■■□□□ 1.43
SLC20A1-201ENST00000272542 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.95■■□□□ 1.42
SLC20A1-201ENST00000272542 ARAP1Q96P48 1450 aa23.93■■□□□ 1.42
SLC20A1-201ENST00000272542 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.89■■□□□ 1.41
SLC20A1-201ENST00000272542 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SLC20A1-201ENST00000272542 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.87■■□□□ 1.41
SLC20A1-201ENST00000272542 ITGAEP38570 1179 aa23.84■■□□□ 1.41
SLC20A1-201ENST00000272542 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC20A1-201ENST00000272542 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SLC20A1-201ENST00000272542 PRDM2Q13029 1718 aa23.77■■□□□ 1.4
SLC20A1-201ENST00000272542 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SLC20A1-201ENST00000272542 TOPBP1Q92547 1522 aa23.75■■□□□ 1.39
SLC20A1-201ENST00000272542 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SLC20A1-201ENST00000272542 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.64■■□□□ 1.37
SLC20A1-201ENST00000272542 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC20A1-201ENST00000272542 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC20A1-201ENST00000272542 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SLC20A1-201ENST00000272542 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.55■■□□□ 1.36
SLC20A1-201ENST00000272542 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.52■■□□□ 1.36
SLC20A1-201ENST00000272542 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SLC20A1-201ENST00000272542 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.46■■□□□ 1.35
SLC20A1-201ENST00000272542 ARID3CA6NKF2 412 aa23.45■■□□□ 1.34
SLC20A1-201ENST00000272542 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.44■■□□□ 1.34
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