RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477585.1

AGRN-206, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 3

Gene AGRN, Length 707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-206ENST00000477585 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.2■■■■■ 7.07
AGRN-206ENST00000477585 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.77■■■■■ 6.04
AGRN-206ENST00000477585 ABCC9O60706 1549 aa51.65■■■■■ 5.86
AGRN-206ENST00000477585 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.72■■■■■ 5.55
AGRN-206ENST00000477585 NACADO15069 1562 aa49.64■■■■■ 5.54
AGRN-206ENST00000477585 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.46■■■■■ 5.51
AGRN-206ENST00000477585 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.32■■■■■ 5.49
AGRN-206ENST00000477585 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
AGRN-206ENST00000477585 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.04■■■■■ 5.44
AGRN-206ENST00000477585 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.58■■■■■ 5.37
AGRN-206ENST00000477585 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.21■■■■■ 5.31
AGRN-206ENST00000477585 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.16■■■■■ 5.3
AGRN-206ENST00000477585 SCRIBQ14160 1630 aa48.03■■■■■ 5.28
AGRN-206ENST00000477585 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.75■■■■■ 5.23
AGRN-206ENST00000477585 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.5■■■■■ 5.19
AGRN-206ENST00000477585 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
AGRN-206ENST00000477585 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.76■■■■■ 5.08
AGRN-206ENST00000477585 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.46■■■■■ 5.03
AGRN-206ENST00000477585 SMARCA4P51532 1647 aa45.97■■■■■ 4.95
AGRN-206ENST00000477585 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.92■■■■■ 4.94
AGRN-206ENST00000477585 NCAPD3P42695 1498 aa45.78■■■■■ 4.92
AGRN-206ENST00000477585 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.75■■■■■ 4.91
AGRN-206ENST00000477585 SMARCA2P51531 1590 aa45.74■■■■■ 4.91
AGRN-206ENST00000477585 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.58■■■■■ 4.89
AGRN-206ENST00000477585 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.56■■■■■ 4.88
AGRN-206ENST00000477585 HMGXB3Q12766 1538 aa45.55■■■■■ 4.88
AGRN-206ENST00000477585 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
AGRN-206ENST00000477585 WIZO95785 1651 aa45.1■■■■■ 4.81
AGRN-206ENST00000477585 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
AGRN-206ENST00000477585 NESP48681 1621 aa44.64■■■■■ 4.74
AGRN-206ENST00000477585 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
AGRN-206ENST00000477585 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.61■■■■■ 4.73
AGRN-206ENST00000477585 ERCC6Q03468 1493 aa44.58■■■■■ 4.73
AGRN-206ENST00000477585 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.43■■■■■ 4.7
AGRN-206ENST00000477585 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.31■■■■■ 4.68
AGRN-206ENST00000477585 CUX2O14529 1486 aa44.21■■■■■ 4.67
AGRN-206ENST00000477585 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.17■■■■■ 4.66
AGRN-206ENST00000477585 CFTRP13569 1480 aa44.13■■■■■ 4.65
AGRN-206ENST00000477585 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.08■■■■■ 4.65
AGRN-206ENST00000477585 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
AGRN-206ENST00000477585 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.9■■■■■ 4.62
AGRN-206ENST00000477585 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.88■■■■■ 4.61
AGRN-206ENST00000477585 PRDM2Q13029 1718 aa43.86■■■■■ 4.61
AGRN-206ENST00000477585 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.83■■■■■ 4.61
AGRN-206ENST00000477585 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
AGRN-206ENST00000477585 WDR62O43379 1518 aa43.7■■■■■ 4.59
AGRN-206ENST00000477585 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
AGRN-206ENST00000477585 ABCC8Q09428 1581 aa43.25■■■■■ 4.51
AGRN-206ENST00000477585 TOPBP1Q92547 1522 aa43.18■■■■■ 4.5
AGRN-206ENST00000477585 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.14■■■■■ 4.5
AGRN-206ENST00000477585 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.99■■■■■ 4.47
AGRN-206ENST00000477585 IFT140Q96RY7 1462 aa42.97■■■■■ 4.47
AGRN-206ENST00000477585 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
AGRN-206ENST00000477585 CUX1P39880 1505 aa42.77■■■■■ 4.44
AGRN-206ENST00000477585 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
AGRN-206ENST00000477585 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
AGRN-206ENST00000477585 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.67■■■■■ 4.42
AGRN-206ENST00000477585 SOGA1O94964 1423 aa42.63■■■■■ 4.41
AGRN-206ENST00000477585 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
AGRN-206ENST00000477585 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.58■■■■■ 4.41
AGRN-206ENST00000477585 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.47■■■■■ 4.399e-7■■■□□ 18.8
AGRN-206ENST00000477585 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.47■■■■■ 4.391e-7■■■■□ 21.9
AGRN-206ENST00000477585 WDR97A6NE52 1622 aa42.46■■■■■ 4.39
AGRN-206ENST00000477585 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.42■■■■■ 4.38
AGRN-206ENST00000477585 TOP2BQ02880 1626 aa42.42■■■■■ 4.38
AGRN-206ENST00000477585 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
AGRN-206ENST00000477585 SYNJ1O43426 1573 aa42.34■■■■■ 4.37
AGRN-206ENST00000477585 OSCARQ8IYS5 282 aa42.33■■■■■ 4.37
AGRN-206ENST00000477585 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.28■■■■■ 4.36
AGRN-206ENST00000477585 GRIN2BQ13224 1484 aa42.17■■■■■ 4.34
AGRN-206ENST00000477585 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.14■■■■■ 4.34
AGRN-206ENST00000477585 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.12■■■■■ 4.33
AGRN-206ENST00000477585 CHD1O14646 1710 aa42.1■■■■■ 4.33
AGRN-206ENST00000477585 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.09■■■■■ 4.33
AGRN-206ENST00000477585 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
AGRN-206ENST00000477585 PBRM1Q86U86 1689 aa42.08■■■■■ 4.33
AGRN-206ENST00000477585 FBLN2P98095 1184 aa42■■■■■ 4.31
AGRN-206ENST00000477585 SYNJ2O15056 1496 aa41.91■■■■■ 4.3
AGRN-206ENST00000477585 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
AGRN-206ENST00000477585 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.79■■■■■ 4.28
AGRN-206ENST00000477585 ADAMTS12P58397 1594 aa41.71■■■■■ 4.27
AGRN-206ENST00000477585 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.67■■■■■ 4.26
AGRN-206ENST00000477585 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.64■■■■■ 4.26
AGRN-206ENST00000477585 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.64■■■■■ 4.26
AGRN-206ENST00000477585 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.64■■■■■ 4.26
AGRN-206ENST00000477585 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.63■■■■■ 4.25
AGRN-206ENST00000477585 KIF27Q86VH2 1401 aa41.62■■■■■ 4.25
AGRN-206ENST00000477585 ARHGEF11O15085 1522 aa41.62■■■■■ 4.25
AGRN-206ENST00000477585 GRIN2AQ12879 1464 aa41.61■■■■■ 4.25
AGRN-206ENST00000477585 TRIM41Q8WV44 630 aa41.45■■■■■ 4.23
AGRN-206ENST00000477585 NUP160Q12769 1436 aa41.44■■■■■ 4.23
AGRN-206ENST00000477585 IGF1RP08069 1367 aa41.44■■■■■ 4.22
AGRN-206ENST00000477585 CUL7Q14999 1698 aa41.39■■■■■ 4.22
AGRN-206ENST00000477585 CEP170Q5SW79 1584 aa41.39■■■■■ 4.22
AGRN-206ENST00000477585 ARAP1Q96P48 1450 aa41.26■■■■■ 4.2
AGRN-206ENST00000477585 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.22■■■■■ 4.19
AGRN-206ENST00000477585 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.21■■■■■ 4.19
AGRN-206ENST00000477585 SHROOM2Q13796 1616 aa41.16■■■■■ 4.18
AGRN-206ENST00000477585 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.11■■■■■ 4.17
AGRN-206ENST00000477585 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.03■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms