Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP47Q6ZTR5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP47Q6ZTR5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CFAP47Q6ZTR5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP47Q6ZTR5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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