Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD1Q6UWL2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SUSD1Q6UWL2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SUSD1Q6UWL2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SUSD1Q6UWL2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms