Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C16orf54Q6UWD8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms