Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC171Q6TFL3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC171Q6TFL3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC171Q6TFL3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms