Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM220Q6QAJ8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM220Q6QAJ8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM220Q6QAJ8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM220Q6QAJ8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms