Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC62Q6P9F0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC62Q6P9F0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC62Q6P9F0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC62Q6P9F0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms