Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLC3Q6P597 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLC3Q6P597 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLC3Q6P597 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLC3Q6P597 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLC3Q6P597 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLC3Q6P597 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLC3Q6P597 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLC3Q6P597 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLC3Q6P597 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLC3Q6P597 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLC3Q6P597 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms