Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K1

SLC48A1, Heme transporter HRG1, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC48A1Q6P1K1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC48A1Q6P1K1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC48A1Q6P1K1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC48A1Q6P1K1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC48A1Q6P1K1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC48A1Q6P1K1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC48A1Q6P1K1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC48A1Q6P1K1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC48A1Q6P1K1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC48A1Q6P1K1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC48A1Q6P1K1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC48A1Q6P1K1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC48A1Q6P1K1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC48A1Q6P1K1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms