Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MALRD1Q5VYJ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALRD1Q5VYJ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALRD1Q5VYJ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms