Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RSBN1Q5VWQ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RSBN1Q5VWQ0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RSBN1Q5VWQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms