Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MLIPQ5VWP3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MLIPQ5VWP3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MLIPQ5VWP3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms