Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATAD3CQ5T2N8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATAD3CQ5T2N8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATAD3CQ5T2N8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms