Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NHSL1Q5SYE7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
NHSL1Q5SYE7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NHSL1Q5SYE7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NHSL1Q5SYE7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms