Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL8

PRAMEF19, PRAME family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF19Q5SWL8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF19Q5SWL8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF19Q5SWL8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF19Q5SWL8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF19Q5SWL8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF19Q5SWL8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF19Q5SWL8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF19Q5SWL8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF19Q5SWL8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAMEF19Q5SWL8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF19Q5SWL8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF19Q5SWL8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms