Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KHDC3LQ587J8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KHDC3LQ587J8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KHDC3LQ587J8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms