Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFT2D3Q587I9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFT2D3Q587I9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFT2D3Q587I9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFT2D3Q587I9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms