Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC44A4Q53GD3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC44A4Q53GD3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC44A4Q53GD3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC44A4Q53GD3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms