Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM259Q4ZIN3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM259Q4ZIN3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM259Q4ZIN3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms