Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TIMM50Q3ZCQ8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TIMM50Q3ZCQ8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM50Q3ZCQ8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms