Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC27Q2M243 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC27Q2M243 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC27Q2M243 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC27Q2M243 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
CCDC27Q2M243 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CCDC27Q2M243 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCDC27Q2M243 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCDC27Q2M243 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms