Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.882e-65■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.672e-65■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 DKC1-210ENST00000481062 819 ntTSL 214.2□□□□□ -0.142e-65■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 DKC1-209ENST00000475966 902 ntTSL 510.91□□□□□ -0.662e-65■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 DKC1-204ENST00000426673 843 ntTSL 510.47□□□□□ -0.732e-65■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 DKC1-202ENST00000412124 670 ntTSL 57.91□□□□□ -1.142e-65■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.62e-65■■■■□ 24.7
NOLC1Q14978 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.738e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.448e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.358e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.028e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.018e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.958e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 ZBTB46-205ENST00000480766 629 ntTSL 320.86■□□□□ 0.938e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 ILKAP-204ENST00000463129 1861 ntTSL 220.69■□□□□ 0.98e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.828e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.71e-10■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.641e-10■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.628e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 ILKAP-202ENST00000450411 1024 ntTSL 218.75■□□□□ 0.598e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.581e-10■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 417.88■□□□□ 0.458e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 KDM4B-212ENST00000624683 5076 nt16.54■□□□□ 0.248e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 216.03■□□□□ 0.161e-10■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.158e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 ILKAP-206ENST00000466468 2651 ntTSL 214.95□□□□□ -0.028e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 ILKAP-205ENST00000465131 750 ntTSL 214.9□□□□□ -0.028e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 IMPDH2-202ENST00000429182 1469 ntTSL 513.53□□□□□ -0.248e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 IMPDH2-201ENST00000326739 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.48e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CEP192-204ENST00000507064 706 ntTSL 312.47□□□□□ -0.418e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 IMPDH2-211ENST00000491610 844 ntTSL 511.27□□□□□ -0.618e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 TUBA1A-202ENST00000301071 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.648e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 IMPDH2-203ENST00000442157 865 ntTSL 210.63□□□□□ -0.718e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.788e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 IMPDH2-204ENST00000462980 908 ntTSL 29.82□□□□□ -0.848e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CEP192-214ENST00000589596 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 28.49□□□□□ -1.058e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.278e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.338e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.588e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.68e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.748e-7■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.45□□□□□ -1.861e-323■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 AC124312.1-202ENST00000557230 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.8□□□□□ -1.169e-8■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.289e-8■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 SNHG14-214ENST00000551361 550 ntTSL 36.7□□□□□ -1.349e-8■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.889e-8■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.031e-20■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.631e-20■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.631e-20■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.631e-20■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CLTA-208ENST00000493185 714 ntTSL 322.51■■□□□ 1.191e-20■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.071e-20■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CLTA-205ENST00000464497 1890 ntTSL 521.33■■□□□ 1.011e-20■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-20■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.441e-20■■■■□ 24.6
NOLC1Q14978 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.744e-7■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.344e-7■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 NDUFS2-203ENST00000465923 1193 ntTSL 315.54■□□□□ 0.084e-7■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 NDUFS2-211ENST00000483804 1062 ntTSL 513.09□□□□□ -0.314e-7■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 NDUFS2-205ENST00000468828 899 ntTSL 312.74□□□□□ -0.374e-7■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 NDUFS2-213ENST00000493849 910 ntTSL 35.63□□□□□ -1.514e-7■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.056e-11■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.36e-11■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.45e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.055e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.995e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 221.13■□□□□ 0.975e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-203ENST00000472367 794 ntTSL 319.67■□□□□ 0.745e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-212ENST00000483588 688 ntTSL 318.97■□□□□ 0.635e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-229ENST00000584177 574 ntTSL 418.42■□□□□ 0.545e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.085e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.085e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.045e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.055e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-217ENST00000497774 1662 ntTSL 514.46□□□□□ -0.095e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-215ENST00000491009 863 ntTSL 214.08□□□□□ -0.165e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-206ENST00000477249 891 ntTSL 514.08□□□□□ -0.165e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.315e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-207ENST00000478103 712 ntTSL 311.37□□□□□ -0.595e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-227ENST00000583400 712 ntTSL 410.9□□□□□ -0.665e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.685e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-201ENST00000460249 773 ntTSL 310.73□□□□□ -0.695e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-222ENST00000580770 572 ntTSL 410.73□□□□□ -0.695e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-204ENST00000475947 598 ntTSL 210.73□□□□□ -0.695e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-221ENST00000580180 753 ntTSL 29.67□□□□□ -0.865e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.025e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-230ENST00000584926 604 ntTSL 58.1□□□□□ -1.115e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-210ENST00000481898 993 ntTSL 1 (best)7.8□□□□□ -1.165e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-211ENST00000483140 936 ntTSL 26.69□□□□□ -1.345e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 LRRC75A-AS1-216ENST00000492250 565 ntTSL 55.6□□□□□ -1.515e-28■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 DDX39B-204ENST00000418897 583 ntTSL 312.83□□□□□ -0.361e-323■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 DDX39B-213ENST00000456976 720 ntTSL 512.81□□□□□ -0.361e-323■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 DDX39B-205ENST00000419020 583 ntTSL 312.47□□□□□ -0.411e-323■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 DDX39B-209ENST00000428450 633 ntTSL 412.44□□□□□ -0.421e-323■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 ATP6V1G2-DDX39B-203ENST00000480131 552 ntAPPRIS P1 TSL 412.28□□□□□ -0.441e-323■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 DDX39B-211ENST00000449757 591 ntTSL 311.25□□□□□ -0.611e-323■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.21□□□□□ -1.741e-323■■■■□ 24.5
NOLC1Q14978 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.166e-11■■■■□ 24.5
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