RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493185.2

CLTA-208, Transcript of clathrin light chain A, humanhuman

TSL 3

Gene CLTA, Length 714 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTA-208ENST00000493185 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.92■■■■■ 5.74
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CLTA-208ENST00000493185 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.21■■■■■ 4.51
CLTA-208ENST00000493185 NACADO15069 1562 aa43.01■■■■■ 4.48
CLTA-208ENST00000493185 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.84■■■■■ 4.45
CLTA-208ENST00000493185 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.52■■■■■ 4.4
CLTA-208ENST00000493185 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
CLTA-208ENST00000493185 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.23■■■■■ 4.35
CLTA-208ENST00000493185 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.1■■■■■ 4.33
CLTA-208ENST00000493185 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.1■■■■■ 4.33
CLTA-208ENST00000493185 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.98■■■■■ 4.31
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CLTA-208ENST00000493185 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.43■■■■■ 4.22
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CLTA-208ENST00000493185 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.85■■■■■ 4.13
CLTA-208ENST00000493185 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.68■■■■■ 4.1
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CLTA-208ENST00000493185 SMARCA2P51531 1590 aa39.55■■■■□ 3.92
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CLTA-208ENST00000493185 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.27■■■■□ 3.88
CLTA-208ENST00000493185 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
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CLTA-208ENST00000493185 ERCC6Q03468 1493 aa39.04■■■■□ 3.84
CLTA-208ENST00000493185 NESP48681 1621 aa38.9■■■■□ 3.82
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CLTA-208ENST00000493185 WIZO95785 1651 aa38.8■■■■□ 3.8
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CLTA-208ENST00000493185 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.51■■■■□ 3.76
CLTA-208ENST00000493185 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.48■■■■□ 3.75
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CLTA-208ENST00000493185 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.46■■■■□ 3.75
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CLTA-208ENST00000493185 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.35■■■■□ 3.73
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CLTA-208ENST00000493185 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.09■■■■□ 3.69
CLTA-208ENST00000493185 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.06■■■■□ 3.68
CLTA-208ENST00000493185 WDR62O43379 1518 aa38.03■■■■□ 3.68
CLTA-208ENST00000493185 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.88■■■■□ 3.65
CLTA-208ENST00000493185 PRDM2Q13029 1718 aa37.84■■■■□ 3.65
CLTA-208ENST00000493185 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
CLTA-208ENST00000493185 TOPBP1Q92547 1522 aa37.37■■■■□ 3.57
CLTA-208ENST00000493185 ABCC8Q09428 1581 aa37.36■■■■□ 3.57
CLTA-208ENST00000493185 IFT140Q96RY7 1462 aa37.3■■■■□ 3.56
CLTA-208ENST00000493185 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.29■■■■□ 3.56
CLTA-208ENST00000493185 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
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CLTA-208ENST00000493185 OSCARQ8IYS5 282 aa37.11■■■■□ 3.53
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CLTA-208ENST00000493185 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.51
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CLTA-208ENST00000493185 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.85■■■■□ 3.49
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CLTA-208ENST00000493185 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.83■■■■□ 3.49
CLTA-208ENST00000493185 WDR97A6NE52 1622 aa36.71■■■■□ 3.47
CLTA-208ENST00000493185 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
CLTA-208ENST00000493185 CHD1O14646 1710 aa36.68■■■■□ 3.46
CLTA-208ENST00000493185 FBLN2P98095 1184 aa36.6■■■■□ 3.45
CLTA-208ENST00000493185 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.58■■■■□ 3.45
CLTA-208ENST00000493185 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.58■■■■□ 3.45
CLTA-208ENST00000493185 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.58■■■■□ 3.45
CLTA-208ENST00000493185 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.54■■■■□ 3.44
CLTA-208ENST00000493185 GRIN2BQ13224 1484 aa36.5■■■■□ 3.43
CLTA-208ENST00000493185 ARHGEF11O15085 1522 aa36.5■■■■□ 3.43
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CLTA-208ENST00000493185 PBRM1Q86U86 1689 aa36.41■■■■□ 3.42
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CLTA-208ENST00000493185 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.01■■■■□ 3.36
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CLTA-208ENST00000493185 NUP160Q12769 1436 aa35.88■■■■□ 3.33
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CLTA-208ENST00000493185 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
CLTA-208ENST00000493185 KIF27Q86VH2 1401 aa35.7■■■■□ 3.31
CLTA-208ENST00000493185 SHROOM2Q13796 1616 aa35.69■■■■□ 3.3
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CLTA-208ENST00000493185 CUL7Q14999 1698 aa35.58■■■■□ 3.29
CLTA-208ENST00000493185 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.54■■■■□ 3.28
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