RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622223.4

ILKAP-212, Transcript of ILK associated serine/threonine phosphatase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ILKAP, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILKAP-212ENST00000622223 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.24■■■■■ 4.83
ILKAP-212ENST00000622223 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.4■■■■■ 4.06
ILKAP-212ENST00000622223 ABCC9O60706 1549 aa39.48■■■■□ 3.91
ILKAP-212ENST00000622223 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.08■■■■□ 3.69
ILKAP-212ENST00000622223 NACADO15069 1562 aa38.05■■■■□ 3.68
ILKAP-212ENST00000622223 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.9■■■■□ 3.66
ILKAP-212ENST00000622223 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
ILKAP-212ENST00000622223 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.59■■■■□ 3.61
ILKAP-212ENST00000622223 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.59■■■■□ 3.61
ILKAP-212ENST00000622223 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.1■■■■□ 3.53
ILKAP-212ENST00000622223 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.87■■■■□ 3.49
ILKAP-212ENST00000622223 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.79■■■■□ 3.48
ILKAP-212ENST00000622223 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.75■■■■□ 3.47
ILKAP-212ENST00000622223 SCRIBQ14160 1630 aa36.58■■■■□ 3.45
ILKAP-212ENST00000622223 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.42■■■■□ 3.42
ILKAP-212ENST00000622223 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
ILKAP-212ENST00000622223 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.79■■■■□ 3.32
ILKAP-212ENST00000622223 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.6■■■■□ 3.29
ILKAP-212ENST00000622223 NCAPD3P42695 1498 aa35.11■■■■□ 3.21
ILKAP-212ENST00000622223 SMARCA4P51532 1647 aa35.11■■■■□ 3.21
ILKAP-212ENST00000622223 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
ILKAP-212ENST00000622223 SMARCA2P51531 1590 aa35.01■■■■□ 3.2
ILKAP-212ENST00000622223 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35■■■■□ 3.19
ILKAP-212ENST00000622223 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.92■■■■□ 3.18
ILKAP-212ENST00000622223 HMGXB3Q12766 1538 aa34.91■■■■□ 3.18
ILKAP-212ENST00000622223 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.75■■■■□ 3.15
ILKAP-212ENST00000622223 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
ILKAP-212ENST00000622223 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
ILKAP-212ENST00000622223 WIZO95785 1651 aa34.32■■■■□ 3.08
ILKAP-212ENST00000622223 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.19■■■■□ 3.06
ILKAP-212ENST00000622223 ERCC6Q03468 1493 aa34.1■■■■□ 3.05
ILKAP-212ENST00000622223 NESP48681 1621 aa34.08■■■■□ 3.05
ILKAP-212ENST00000622223 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
ILKAP-212ENST00000622223 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.01■■■■□ 3.04
ILKAP-212ENST00000622223 CUX2O14529 1486 aa34■■■■□ 3.03
ILKAP-212ENST00000622223 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.96■■■■□ 3.03
ILKAP-212ENST00000622223 CFTRP13569 1480 aa33.79■■■■□ 3
ILKAP-212ENST00000622223 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
ILKAP-212ENST00000622223 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.72■■■□□ 2.99
ILKAP-212ENST00000622223 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.62■■■□□ 2.97
ILKAP-212ENST00000622223 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.56■■■□□ 2.96
ILKAP-212ENST00000622223 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.56■■■□□ 2.96
ILKAP-212ENST00000622223 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.56■■■□□ 2.96
ILKAP-212ENST00000622223 WDR62O43379 1518 aa33.49■■■□□ 2.95
ILKAP-212ENST00000622223 PRDM2Q13029 1718 aa33.49■■■□□ 2.95
ILKAP-212ENST00000622223 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
ILKAP-212ENST00000622223 ABCC8Q09428 1581 aa33.16■■■□□ 2.9
ILKAP-212ENST00000622223 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.14■■■□□ 2.9
ILKAP-212ENST00000622223 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
ILKAP-212ENST00000622223 TOPBP1Q92547 1522 aa33■■■□□ 2.87
ILKAP-212ENST00000622223 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.97■■■□□ 2.87
ILKAP-212ENST00000622223 IFT140Q96RY7 1462 aa32.92■■■□□ 2.86
ILKAP-212ENST00000622223 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
ILKAP-212ENST00000622223 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
ILKAP-212ENST00000622223 CUX1P39880 1505 aa32.63■■■□□ 2.81
ILKAP-212ENST00000622223 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
ILKAP-212ENST00000622223 WDR97A6NE52 1622 aa32.59■■■□□ 2.81
ILKAP-212ENST00000622223 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.56■■■□□ 2.8
ILKAP-212ENST00000622223 SOGA1O94964 1423 aa32.56■■■□□ 2.8
ILKAP-212ENST00000622223 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
ILKAP-212ENST00000622223 OSCARQ8IYS5 282 aa32.47■■■□□ 2.79
ILKAP-212ENST00000622223 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.46■■■□□ 2.79
ILKAP-212ENST00000622223 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.42■■■□□ 2.784e-7■■■■□ 24.6
ILKAP-212ENST00000622223 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.38■■■□□ 2.77
ILKAP-212ENST00000622223 TOP2BQ02880 1626 aa32.37■■■□□ 2.77
ILKAP-212ENST00000622223 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.37■■■□□ 2.77
ILKAP-212ENST00000622223 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.34■■■□□ 2.77
ILKAP-212ENST00000622223 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.77
ILKAP-212ENST00000622223 GRIN2BQ13224 1484 aa32.26■■■□□ 2.75
ILKAP-212ENST00000622223 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
ILKAP-212ENST00000622223 SYNJ1O43426 1573 aa32.24■■■□□ 2.75
ILKAP-212ENST00000622223 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.2■■■□□ 2.75
ILKAP-212ENST00000622223 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.18■■■□□ 2.74
ILKAP-212ENST00000622223 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.15■■■□□ 2.74
ILKAP-212ENST00000622223 CHD1O14646 1710 aa32.14■■■□□ 2.74
ILKAP-212ENST00000622223 PBRM1Q86U86 1689 aa32.09■■■□□ 2.73
ILKAP-212ENST00000622223 SYNJ2O15056 1496 aa32.09■■■□□ 2.73
ILKAP-212ENST00000622223 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
ILKAP-212ENST00000622223 FBLN2P98095 1184 aa32■■■□□ 2.71
ILKAP-212ENST00000622223 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.97■■■□□ 2.71
ILKAP-212ENST00000622223 ARHGEF11O15085 1522 aa31.9■■■□□ 2.7
ILKAP-212ENST00000622223 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.9■■■□□ 2.7
ILKAP-212ENST00000622223 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.89■■■□□ 2.7
ILKAP-212ENST00000622223 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.89■■■□□ 2.7
ILKAP-212ENST00000622223 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.89■■■□□ 2.7
ILKAP-212ENST00000622223 ADAMTS12P58397 1594 aa31.86■■■□□ 2.69
ILKAP-212ENST00000622223 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.86■■■□□ 2.69
ILKAP-212ENST00000622223 GRIN2AQ12879 1464 aa31.82■■■□□ 2.68
ILKAP-212ENST00000622223 KIF27Q86VH2 1401 aa31.76■■■□□ 2.68
ILKAP-212ENST00000622223 NUP160Q12769 1436 aa31.75■■■□□ 2.67
ILKAP-212ENST00000622223 TRIM41Q8WV44 630 aa31.7■■■□□ 2.67
ILKAP-212ENST00000622223 IGF1RP08069 1367 aa31.64■■■□□ 2.66
ILKAP-212ENST00000622223 CUL7Q14999 1698 aa31.61■■■□□ 2.65
ILKAP-212ENST00000622223 CEP170Q5SW79 1584 aa31.61■■■□□ 2.65
ILKAP-212ENST00000622223 ARAP1Q96P48 1450 aa31.6■■■□□ 2.65
ILKAP-212ENST00000622223 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.53■■■□□ 2.64
ILKAP-212ENST00000622223 SHROOM2Q13796 1616 aa31.52■■■□□ 2.64
ILKAP-212ENST00000622223 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.43■■■□□ 2.62
ILKAP-212ENST00000622223 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.4■■■□□ 2.62
ILKAP-212ENST00000622223 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.39■■■□□ 2.61
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