Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPARCL1Q14515 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPARCL1Q14515 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPARCL1Q14515 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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