Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
COL9A3Q14050 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
COL9A3Q14050 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
COL9A3Q14050 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL9A3Q14050 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL9A3Q14050 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
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