Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRPF4BQ13523 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRPF4BQ13523 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF4BQ13523 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF4BQ13523 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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