Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MKRN4PQ13434 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
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