Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGB3BPQ13352 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ITGB3BPQ13352 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGB3BPQ13352 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
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