Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPRL3Q12980 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPRL3Q12980 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPRL3Q12980 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPRL3Q12980 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPRL3Q12980 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPRL3Q12980 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPRL3Q12980 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPRL3Q12980 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPRL3Q12980 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NPRL3Q12980 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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