Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TFF3Q07654 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFF3Q07654 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TFF3Q07654 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFF3Q07654 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFF3Q07654 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFF3Q07654 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TFF3Q07654 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TFF3Q07654 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TFF3Q07654 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TFF3Q07654 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFF3Q07654 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFF3Q07654 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TFF3Q07654 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFF3Q07654 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFF3Q07654 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFF3Q07654 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TFF3Q07654 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TFF3Q07654 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TFF3Q07654 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFF3Q07654 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TFF3Q07654 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TFF3Q07654 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFF3Q07654 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TFF3Q07654 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TFF3Q07654 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TFF3Q07654 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TFF3Q07654 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFF3Q07654 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFF3Q07654 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFF3Q07654 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFF3Q07654 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TFF3Q07654 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TFF3Q07654 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFF3Q07654 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFF3Q07654 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TFF3Q07654 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TFF3Q07654 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TFF3Q07654 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TFF3Q07654 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms