Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTPN11Q06124 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PTPN11Q06124 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPN11Q06124 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms