Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EMX1Q04741 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMX1Q04741 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EMX1Q04741 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms