Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP4A11Q02928 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP4A11Q02928 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP4A11Q02928 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms