Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SATB1Q01826 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SATB1Q01826 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms