Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP2B2Q01814 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2B2Q01814 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B2Q01814 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms