Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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FAM3AP98173 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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FAM3AP98173 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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FAM3AP98173 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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FAM3AP98173 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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FAM3AP98173 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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FAM3AP98173 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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FAM3AP98173 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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FAM3AP98173 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
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FAM3AP98173 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
FAM3AP98173 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAM3AP98173 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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