Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX3P78415 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX3P78415 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX3P78415 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX3P78415 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX3P78415 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX3P78415 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX3P78415 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX3P78415 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX3P78415 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX3P78415 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX3P78415 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX3P78415 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX3P78415 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX3P78415 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX3P78415 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX3P78415 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRX3P78415 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX3P78415 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRX3P78415 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX3P78415 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX3P78415 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRX3P78415 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX3P78415 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX3P78415 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX3P78415 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX3P78415 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX3P78415 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRX3P78415 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRX3P78415 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX3P78415 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX3P78415 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX3P78415 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX3P78415 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX3P78415 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX3P78415 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX3P78415 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IRX3P78415 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX3P78415 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX3P78415 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX3P78415 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX3P78415 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX3P78415 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRX3P78415 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX3P78415 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX3P78415 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX3P78415 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX3P78415 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX3P78415 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRX3P78415 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IRX3P78415 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IRX3P78415 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX3P78415 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX3P78415 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX3P78415 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX3P78415 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX3P78415 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRX3P78415 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX3P78415 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX3P78415 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX3P78415 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX3P78415 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRX3P78415 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX3P78415 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX3P78415 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRX3P78415 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX3P78415 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX3P78415 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX3P78415 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX3P78415 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRX3P78415 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX3P78415 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX3P78415 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRX3P78415 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX3P78415 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX3P78415 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRX3P78415 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
IRX3P78415 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX3P78415 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX3P78415 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX3P78415 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX3P78415 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX3P78415 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX3P78415 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRX3P78415 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX3P78415 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRX3P78415 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX3P78415 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX3P78415 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX3P78415 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX3P78415 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX3P78415 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IRX3P78415 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX3P78415 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX3P78415 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX3P78415 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX3P78415 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX3P78415 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX3P78415 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IRX3P78415 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms