Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPNP63162 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPNP63162 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPNP63162 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms